Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SF3B3Q15393 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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