Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3CQ15386 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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