Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms