Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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