Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3GAP1Q15042 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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