Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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LAPTM4AQ15012 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAPTM4AQ15012 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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LAPTM4AQ15012 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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LAPTM4AQ15012 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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