Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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