Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS1Q14691 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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