Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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FAT1Q14517 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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FAT1Q14517 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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FAT1Q14517 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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FAT1Q14517 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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FAT1Q14517 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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FAT1Q14517 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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FAT1Q14517 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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FAT1Q14517 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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FAT1Q14517 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAT1Q14517 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms