Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms