Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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