Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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PDE6HQ13956 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PDE6HQ13956 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PDE6HQ13956 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PDE6HQ13956 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PDE6HQ13956 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PDE6HQ13956 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PDE6HQ13956 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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