Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms