Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF9Q13886 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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