Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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