Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms