Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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