Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
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