Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
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