Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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