Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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SNTA1Q13424 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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SNTA1Q13424 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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SNTA1Q13424 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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SNTA1Q13424 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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