Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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