Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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