Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKP2Q13309 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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