Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME3Q13232 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME3Q13232 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME3Q13232 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME3Q13232 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME3Q13232 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME3Q13232 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME3Q13232 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME3Q13232 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME3Q13232 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME3Q13232 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME3Q13232 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME3Q13232 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME3Q13232 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME3Q13232 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME3Q13232 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME3Q13232 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME3Q13232 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME3Q13232 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME3Q13232 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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