Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
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