Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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