Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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