Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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RAB40BQ12829 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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RAB40BQ12829 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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RAB40BQ12829 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB40BQ12829 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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