Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWF1Q12792 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWF1Q12792 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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