Protein–RNA interactions for Protein: Q12527

ATG11, Autophagy-related protein 11, yeastyeast

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Length 1,178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG11Q12527 ORC2YBR060C 1863 nt2.48□□□□□ -2.01
ATG11Q12527 AFI1YOR129C 2682 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG11Q12527 SVL3YPL032C 2478 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG11Q12527 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG11Q12527 YBR184WYBR184W 1572 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG11Q12527 EFR3YMR212C 2349 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG11Q12527 PEP3YLR148W 2757 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG11Q12527 SIR3YLR442C 2937 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG11Q12527 PHO2YDL106C 1680 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG11Q12527 PXA2YKL188C 2562 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG11Q12527 GRR1YJR090C 3456 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG11Q12527 CFT2YLR115W 2580 nt2.46□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 SCD5YOR329C 2619 nt2.46□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 VIK1YPL253C 1944 nt2.46□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 UBP15YMR304W 3693 nt2.46□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 VPH1YOR270C 2523 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 TRS130YMR218C 3309 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 RPL42BYHR141C 321 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 YJL150WYJL150W 303 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 RPS29AYLR388W 171 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 RPL42AYNL162W 321 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 SAP190YKR028W 3102 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 RIC1YLR039C 3171 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 FAR11YNL127W 2862 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 CDC27YBL084C 2277 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 SWA2YDR320C 2007 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 LCD1YDR499W 2244 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 BRP1YGL007W 378 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 TRX1YLR043C 312 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 CRM1YGR218W 3255 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 CDC53YDL132W 2448 nt2.43□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.43□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 PLC1YPL268W 2610 nt2.43□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 SMY1YKL079W 1971 nt2.43□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 TRS65YGR166W 1683 nt2.42□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 YNL114CYNL114C 372 nt2.42□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 YBL083CYBL083C 426 nt2.42□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 YEF3YLR249W 3135 nt2.42□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 PDE2YOR360C 1581 nt2.41□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 COS111YBR203W 2775 nt2.41□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 ATP8Q0080 147 nt2.41□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 SNF5YBR289W 2718 nt2.41□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 SPT21YMR179W 2277 nt2.4□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 NUP100YKL068W 2880 nt2.4□□□□□ -2.02
ATG11Q12527 YRB1YDR002W 606 nt2.4□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.4□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 YOL098CYOL098C 3114 nt2.4□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 TUS1YLR425W 3924 nt2.39□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 snR72snR72 98 nt2.39□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 EMP24YGL200C 612 nt2.39□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 KRE33YNL132W 3171 nt2.39□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 INP2YMR163C 2118 nt2.39□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 CLN3YAL040C 1743 nt2.39□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 MPT5YGL178W 2580 nt2.39□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 SCH9YHR205W 2475 nt2.39□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 MNL2YLR057W 2550 nt2.37□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 YEL014CYEL014C 306 nt2.37□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 YPR092WYPR092W 306 nt2.37□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 VPS54YDR027C 2670 nt2.37□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 UBR1YGR184C 5853 nt2.37□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 RPH1YER169W 2391 nt2.37□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 UTP22YGR090W 3714 nt2.37□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 snR74snR74 88 nt2.36□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 YDR286CYDR286C 345 nt2.36□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 RPB10YOR210W 213 nt2.36□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 MUK1YPL070W 1839 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 PRP39YML046W 1890 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 HSL1YKL101W 4557 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 MGM1YOR211C 2646 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 OLI1Q0130 231 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 VPS55YJR044C 423 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 PAU8YAL068C 363 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 PAU20YOL161C 363 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 SET2YJL168C 2202 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 SWI5YDR146C 2130 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 MET18YIL128W 3099 nt2.34□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 YLR140WYLR140W 327 nt2.34□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.34□□□□□ -2.03
ATG11Q12527 EDS1YBR033W 2760 nt2.34□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 MRP10YDL045W-A 288 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 PAU18YLL064C 363 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 RRT15YLR162W-A 189 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 PAU6YNR076W 363 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 TFC3YAL001C 3483 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 BNI1YNL271C 5862 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 SEC16YPL085W 6588 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 YGL217CYGL217C 342 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 YCL046WYCL046W 324 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 RFX1YLR176C 2436 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 SWI6YLR182W 2412 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 SEC5YDR166C 2916 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 CHC1YGL206C 4962 nt2.31□□□□□ -2.04
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