Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CPSF1Q10570 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPSF1Q10570 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CPSF1Q10570 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CPSF1Q10570 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CPSF1Q10570 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPSF1Q10570 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPSF1Q10570 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPSF1Q10570 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF1Q10570 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF1Q10570 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF1Q10570 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF1Q10570 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF1Q10570 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF1Q10570 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF1Q10570 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF1Q10570 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF1Q10570 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF1Q10570 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF1Q10570 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF1Q10570 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CPSF1Q10570 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPSF1Q10570 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPSF1Q10570 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPSF1Q10570 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPSF1Q10570 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CPSF1Q10570 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CPSF1Q10570 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CPSF1Q10570 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPSF1Q10570 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CPSF1Q10570 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPSF1Q10570 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPSF1Q10570 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPSF1Q10570 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CPSF1Q10570 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CPSF1Q10570 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPSF1Q10570 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPSF1Q10570 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CPSF1Q10570 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPSF1Q10570 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CPSF1Q10570 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CPSF1Q10570 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CPSF1Q10570 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CPSF1Q10570 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms