Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms