Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMAGPQ0VAQ4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMAGPQ0VAQ4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMAGPQ0VAQ4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMAGPQ0VAQ4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMAGPQ0VAQ4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMAGPQ0VAQ4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMAGPQ0VAQ4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMAGPQ0VAQ4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SMAGPQ0VAQ4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMAGPQ0VAQ4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMAGPQ0VAQ4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMAGPQ0VAQ4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms