Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms