Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PIGFQ07326 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms