Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms