Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 PIG1YLR273C 1947 nt0.99□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 SMC1YFL008W 3678 nt0.99□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 HIT1YJR055W 495 nt0.99□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.99□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.99□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 LYS14YDR034C 2373 nt0.99□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 STB6YKL072W 2301 nt0.99□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 SEC3YER008C 4011 nt0.99□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 PXA2YKL188C 2562 nt0.98□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 RPL32YBL092W 393 nt0.98□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 APL3YBL037W 3078 nt0.98□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 SPT21YMR179W 2277 nt0.98□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.97□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.97□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 GPI15YNL038W 690 nt0.97□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 YNR025CYNR025C 360 nt0.97□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 TSC3YBR058C-A 243 nt0.97□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 NUT2YPR168W 474 nt0.97□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 YLL054CYLL054C 2532 nt0.97□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 SCC2YDR180W 4482 nt0.97□□□□□ -2.25
ATG17Q06410 ENV11YGR071C 2583 nt0.96□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 YDR114CYDR114C 303 nt0.96□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 PIP2YOR363C 2991 nt0.96□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 MXR1YER042W 555 nt0.95□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 EMC4YGL231C 573 nt0.95□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 BIG1YHR101C 1008 nt0.95□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.95□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.95□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 STE18YJR086W 333 nt0.95□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.95□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 NOC3YLR002C 1992 nt0.95□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.94□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 RUF22RUF22 515 nt0.94□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 SIP4YJL089W 2490 nt0.94□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 ROM2YLR371W 4071 nt0.94□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 IFH1YLR223C 3258 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 YGL239CYGL239C 315 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 NBL1YHR199C-A 222 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 GUP1YGL084C 1683 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 DOP1YDR141C 5097 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 YCR001WYCR001W 315 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 RPF1YHR088W 888 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 URM1YIL008W 300 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 EAF6YJR082C 342 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 YLL032CYLL032C 2478 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 MPT5YGL178W 2580 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 YLR269CYLR269C 351 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 PBI2YNL015W 228 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG17Q06410 NUP145YGL092W 3954 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YGR045CYGR045C 363 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 SDH2YLL041C 801 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 KAP120YPL125W 3099 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 SCW11YGL028C 1629 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 RFX1YLR176C 2436 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 SET3YKR029C 2256 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 APL2YKL135C 2181 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 NFU1YKL040C 771 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 MRPL31YKL138C 396 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YBR012CYBR012C 420 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 SWI6YLR182W 2412 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 PHS1YJL097W 654 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 SLD3YGL113W 2007 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 TTI1YKL033W 3117 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 IML1YJR138W 4755 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 ANS1YHR126C 480 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YML003WYML003W 873 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 ERP4YOR016C 624 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YGR130CYGR130C 2451 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 CLU1YMR012W 3834 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YDL158CYDL158C 309 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YDR269CYDR269C 324 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 PRE4YFR050C 801 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 UPS1YLR193C 528 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 HCH1YNL281W 462 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 IRC23YOR044W 474 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YPR153WYPR153W 423 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 ALY2YJL084C 3141 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 CYC7YEL039C 342 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YML108WYML108W 318 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YPL182CYPL182C 384 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 PAU24YBR301W 363 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 NUP157YER105C 4176 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 STO1YMR125W 2586 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 YIL059CYIL059C 366 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 RPL16AYIL133C 600 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 CDC33YOL139C 642 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG17Q06410 SAS3YBL052C 2496 nt0.84□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 SLY1YDR189W 2001 nt0.84□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 AIM9YER080W 1884 nt0.84□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 AIM29YKR074W 468 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG17Q06410 RRT1YBL048W 312 nt0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.6 ms