Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms