Protein–RNA interactions for Protein: Q04749

AVO2, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO2, yeastyeast

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO2Q04749 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.5□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 FIG4YNL325C 2640 nt0.5□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YCR100CYCR100C 951 nt0.49□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YDR509WYDR509W 348 nt0.49□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 MND1YGL183C 660 nt0.49□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 SPO13YHR014W 876 nt0.49□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 TMA22YJR014W 597 nt0.49□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.49□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 RUF22RUF22 515 nt0.49□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YOR199WYOR199W 330 nt0.49□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YBR032WYBR032W 303 nt0.49□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.49□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 SLM6YBR266C 453 nt0.49□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 PDE2YOR360C 1581 nt0.49□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 MMS4YBR098W 2076 nt0.49□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 SWI6YLR182W 2412 nt0.48□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 STO1YMR125W 2586 nt0.48□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 MXR1YER042W 555 nt0.48□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 PAM16YJL104W 450 nt0.48□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YAL066WYAL066W 309 nt0.48□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 LYS14YDR034C 2373 nt0.48□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 SPO23YBR250W 1572 nt0.48□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YAR009CYAR009C 3591 nt0.47□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 ECM9YKR004C 1134 nt0.47□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.47□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YOR248WYOR248W 303 nt0.47□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.47□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YML002WYML002W 2214 nt0.47□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 ALY2YJL084C 3141 nt0.47□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YDR008CYDR008C 351 nt0.46□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.46□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 HIT1YJR055W 495 nt0.46□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 AFB1YLR040C 675 nt0.46□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.46□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 IPP1YBR011C 864 nt0.46□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 SLY1YDR189W 2001 nt0.45□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 snR84snR84 550 nt0.45□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 SCEIQ0160 708 nt0.45□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 YLR252WYLR252W 306 nt0.45□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 YMR254CYMR254C 309 nt0.45□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 IES4YOR189W 351 nt0.45□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 PPN1YDR452W 2025 nt0.45□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 AFR1YDR085C 1863 nt0.44□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 YDL196WYDL196W 330 nt0.44□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 ALG13YGL047W 609 nt0.44□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 UPS1YLR193C 528 nt0.44□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 YIL059CYIL059C 366 nt0.43□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 YJR079WYJR079W 330 nt0.43□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.43□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 YBR063CYBR063C 1215 nt0.43□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 LCD1YDR499W 2244 nt0.43□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 APL2YKL135C 2181 nt0.42□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 YDL187CYDL187C 330 nt0.42□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.42□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 SLX9YGR081C 633 nt0.42□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 ILM1YJR118C 612 nt0.42□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 GMC2YLR445W 567 nt0.42□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 YLL007CYLL007C 1998 nt0.42□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 UTP10YJL109C 5310 nt0.42□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 FMP27YLR454W 7887 nt0.42□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 WAR1YML076C 2835 nt0.42□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 DBP6YNR038W 1890 nt0.41□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 YLL032CYLL032C 2478 nt0.41□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 SLI15YBR156C 2097 nt0.41□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 OCA6YDR067C 675 nt0.41□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 RRT1YBL048W 312 nt0.41□□□□□ -2.34
AVO2Q04749 ENV11YGR071C 2583 nt0.4□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 SWF1YDR126W 1011 nt0.4□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.4□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 ISD11YER048W-A 285 nt0.4□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.4□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YOL029CYOL029C 606 nt0.4□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YDL073WYDL073W 2955 nt0.4□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 SLD3YGL113W 2007 nt0.39□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.39□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 ECM12YHR021W-A 456 nt0.39□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 RFX1YLR176C 2436 nt0.39□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YJR087WYJR087W 351 nt0.38□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 MRPL31YKL138C 396 nt0.38□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 RPL38YLR325C 237 nt0.38□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YPR153WYPR153W 423 nt0.38□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 RKR1YMR247C 4689 nt0.38□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 NPC2YDL046W 522 nt0.37□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 MET32YDR253C 576 nt0.37□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.37□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 RCN2YOR220W 798 nt0.37□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YPR039WYPR039W 336 nt0.37□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 COG4YPR105C 2586 nt0.36□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.36□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.36□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 RPL32YBL092W 393 nt0.36□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YOR282WYOR282W 321 nt0.36□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 LTE1YAL024C 4308 nt0.36□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 PAN2YGL094C 3348 nt0.36□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 VMA21YGR105W 234 nt0.35□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YIL029CYIL029C 429 nt0.35□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 APQ13YJL075C 417 nt0.35□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YLR198CYLR198C 360 nt0.35□□□□□ -2.35
AVO2Q04749 YDR269CYDR269C 324 nt0.34□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 GPG1YGL121C 381 nt0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73.7 ms