Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELAQ04206 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RELAQ04206 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RELAQ04206 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RELAQ04206 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RELAQ04206 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RELAQ04206 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RELAQ04206 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RELAQ04206 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms