Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.78□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YLR434CYLR434C 384 nt1.78□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 KCS1YDR017C 3153 nt1.78□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 SXM1YDR395W 2835 nt1.78□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 FRK1YPL141C 2598 nt1.78□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 HMI1YOL095C 2121 nt1.78□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 OSH6YKR003W 1347 nt1.77□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 RPL31AYDL075W 342 nt1.77□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 ATP6Q0085 780 nt1.77□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 VPS15YBR097W 4365 nt1.77□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 UTP21YLR409C 2820 nt1.76□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 YLR422WYLR422W 5799 nt1.76□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 PMD1YER132C 5262 nt1.76□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 ZRG17YNR039C 1818 nt1.76□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 TIM13YGR181W 318 nt1.76□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 MCM22YJR135C 720 nt1.76□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 PAU18YLL064C 363 nt1.76□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 PAU6YNR076W 363 nt1.76□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.75□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 YPL261CYPL261C 309 nt1.75□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 SPO24YPR036W-A 204 nt1.75□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 YOR019WYOR019W 2193 nt1.75□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 HSL1YKL101W 4557 nt1.74□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 PCF11YDR228C 1881 nt1.74□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.73□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 HIT1YJR055W 495 nt1.73□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 YOR029WYOR029W 336 nt1.73□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 HHT1YBR010W 411 nt1.73□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 YCL046WYCL046W 324 nt1.73□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 SSK2YNR031C 4740 nt1.73□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 SWI5YDR146C 2130 nt1.72□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 AIM9YER080W 1884 nt1.72□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.72□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.72□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.72□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 YOR121CYOR121C 306 nt1.72□□□□□ -2.13
SYF1Q04048 IML1YJR138W 4755 nt1.71□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 WIP1YDR374W-A 270 nt1.71□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.71□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 YKL083WYKL083W 615 nt1.71□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 YPL229WYPL229W 621 nt1.71□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 PHS1YJL097W 654 nt1.7□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 RPL32YBL092W 393 nt1.7□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 SWI6YLR182W 2412 nt1.7□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 PIK1YNL267W 3201 nt1.69□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 YAP6YDR259C 1152 nt1.69□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 GIM4YEL003W 336 nt1.69□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 EMC5YIL027C 426 nt1.69□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.69□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 RPL26AYLR344W 384 nt1.69□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 YCS4YLR272C 3531 nt1.69□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 ZIP1YDR285W 2628 nt1.68□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 ATG31YDR022C 591 nt1.68□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 YML003WYML003W 873 nt1.68□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 HCH1YNL281W 462 nt1.68□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 BST1YFL025C 3090 nt1.67□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 APL2YKL135C 2181 nt1.67□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 ISF1YMR081C 1017 nt1.67□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 RKM1YPL208W 1752 nt1.67□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 MLH3YPL164C 2148 nt1.66□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 EFR3YMR212C 2349 nt1.66□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 YIL059CYIL059C 366 nt1.66□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 YBR012CYBR012C 420 nt1.66□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 YOP1YPR028W 543 nt1.66□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 NCA2YPR155C 1851 nt1.66□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 TTI1YKL033W 3117 nt1.66□□□□□ -2.14
SYF1Q04048 YJR003CYJR003C 1560 nt1.65□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.65□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 RTR1YER139C 681 nt1.65□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.65□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 MON2YNL297C 4911 nt1.65□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 KAP122YGL016W 3246 nt1.65□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 LYS14YDR034C 2373 nt1.65□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 PXA2YKL188C 2562 nt1.64□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 YGR035CYGR035C 351 nt1.64□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 DGR2YKL121W 2559 nt1.64□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 BPH1YCR032W 6504 nt1.64□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 IRA1YBR140C 9279 nt1.63□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 ALK1YGL021W 2283 nt1.63□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.63□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.63□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.63□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.63□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.63□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.63□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.63□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 YJL022WYJL022W 309 nt1.62□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 VPS55YJR044C 423 nt1.62□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 COF1YLL050C 432 nt1.62□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 YAR053WYAR053W 297 nt1.62□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 IRC23YOR044W 474 nt1.62□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 YBR174CYBR174C 315 nt1.62□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 YAR009CYAR009C 3591 nt1.62□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 SLY1YDR189W 2001 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 YPR197CYPR197C 564 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 RPL40BYKR094C 387 nt1.6□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 BIL1YOR304C-A 231 nt1.6□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 YBP1YBR216C 2025 nt1.6□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 RFX1YLR176C 2436 nt1.6□□□□□ -2.15
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