Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms