Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms