Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIST1H1AQ02539 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms