Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP27A1Q02318 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP27A1Q02318 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms