Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms