Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKB2Q00653 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKB2Q00653 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKB2Q00653 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKB2Q00653 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKB2Q00653 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKB2Q00653 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NFKB2Q00653 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFKB2Q00653 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms