Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms