Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL11P62913 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL11P62913 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL11P62913 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL11P62913 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL11P62913 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL11P62913 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL11P62913 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL11P62913 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.5 ms